Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TFF3Q07654 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TFF3Q07654 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TFF3Q07654 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TFF3Q07654 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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