Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms