Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms