Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms