Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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HOXA13P31271 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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HOXA13P31271 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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HOXA13P31271 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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HOXA13P31271 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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HOXA13P31271 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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HOXA13P31271 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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HOXA13P31271 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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HOXA13P31271 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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HOXA13P31271 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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