Protein–RNA interactions for Protein: P28062

PSMB8, Proteasome subunit beta type-8, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB8P28062 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PSMB8P28062 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms