Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK11BP21127 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms