Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms