Protein–RNA interactions for Protein: P09848

LCT, Lactase-phlorizin hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 1,927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTP09848 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LCTP09848 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCTP09848 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCTP09848 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCTP09848 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms