Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RGPD3A6NKT7 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms