Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COX16Q9P0S2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX16Q9P0S2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms