Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms