Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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