Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00526Q96FQ7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms