Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms