Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms