Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms