Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRIM16LQ309B1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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