Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TCEA2Q15560 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms