Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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