Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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