Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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