Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BNIP1Q12981 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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BNIP1Q12981 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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BNIP1Q12981 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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BNIP1Q12981 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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BNIP1Q12981 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BNIP1Q12981 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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