Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA4P48058 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA4P48058 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA4P48058 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms