Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPRDP23468 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPRDP23468 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPRDP23468 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPRDP23468 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPRDP23468 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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