Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYP2C9P11712 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYP2C9P11712 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms