Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F9P00740 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F9P00740 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F9P00740 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F9P00740 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F9P00740 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F9P00740 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F9P00740 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F9P00740 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F9P00740 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F9P00740 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F9P00740 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F9P00740 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F9P00740 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F9P00740 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F9P00740 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms