Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEBLO76041 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms