Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ZNF208O43345 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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