Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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USP20Q9Y2K6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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USP20Q9Y2K6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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USP20Q9Y2K6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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USP20Q9Y2K6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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USP20Q9Y2K6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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USP20Q9Y2K6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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USP20Q9Y2K6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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USP20Q9Y2K6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP20Q9Y2K6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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