Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms