Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ARFGAP3Q9NP61 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARFGAP3Q9NP61 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms