Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms