Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms