Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q499Y3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q499Y3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q499Y3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q499Y3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q499Y3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q499Y3 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q499Y3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q499Y3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms