Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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