Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABPAQ06546 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms