Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASIC1P78348 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms