Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSCP56915 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSCP56915 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSCP56915 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms