Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP4P49662 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP4P49662 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP4P49662 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms