Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXD12P35452 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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