Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms