Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNA5P22460 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms