Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB8P17481 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms