Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIN3BO75182 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms