Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms