Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01558Q9Y6Z2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01558Q9Y6Z2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms