Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POMPQ9Y244 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POMPQ9Y244 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms