Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB9

AURKC, Aurora kinase C, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKCQ9UQB9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AURKCQ9UQB9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms