Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms